云岫庵位于浙江省海临县鹰窠顶近山顶处，始建于北宋建隆初年（960年），海拔150米，面临钱塘江口、集湖光、山色、海景于一处，庵名是从东晋大诗人陶渊明《归去来兮辞》中“云无心以出岫，鸟倦飞而知还”名句拈出则来。
一千多年来，云岫庵五废五兴。宋治平元年（1064年）濒圮而复兴。元至正二年（1342年）僧本原开山。明天顺八年（1464年）毁于兵燹。化成八年（1472年）鼎新。正德六年（1511年）废，隆知五年（1571年）杭州百法寺僧明坚重修。清康熙二十三年（1684年）重修；咸丰十一年（1861年）毁于兵燹，光绪元年（1875年）袁花節妇王复正（聚师太）重建，云岫庵的规模，宋时无考，元至正十二年（1352年）邑人许宸隐居此山，舍山15亩拓宽栋宇。明隆庆时（1571年），许宸五世孙许懋复舍山五亩，建佛殿前后共六间四坡，左右齐堂、禅堂。万历二十二年（1594年），僧性静买山57亩，殿宇募资一新，有殿十楹、阁五楹、右庑四楹、齐堂、静堂、厨房共十楹。其中阁五楹，是万历二十六年（1598年）僧性静从京师请回《大藏经》而特地建造的。清初，云岫庵基本保持明朝规模。
云岫庵从宋初建庵起，就“崇奉观音大士”，元许宸也是“日夕顶礼大士”，明重建后“仍奉观音大士”。在普陀山屡遭倭寇骚扰时，常有僧尼渡海来避难，后流为民间传说：观音菩萨的根本道场在普陀，因香火旺盛，日夜不能安静，于是听从龙女献计，常于晚上跨海来此休息。因消息走漏，善男信女在晚上闻风而至，云岫庵遂有“夜普陀”之称，其烧夜香的传统也沿袭至今。因此云岫庵香火旺盛，每当夜幕来临，总是香煙缭绕，钟鼓齐鸣。
云岫庵地理位置东有鹰窠顶，西有南木山，南有高阳山，北有麂山、荆山、凤凰山，正符合风水学说中“四灵兽”地形，又凤凰山、荆山、云岫庵、高阳山这五点正成一直线，故又称“五星连珠”。自山麓至庵，有磴道名“九曲径”，途中有初憩亭、狮头岩、合掌岩等景。最负盛名者乃每年农历十月初一清晨在鹰窠顶看“日月并升”天文奇观，云岫庵是其隔夜休息和整装待发之地，因此九月三十就成为云岫庵最热闹“庙会”。民国三十六年九月三十夜在云岫庵烧香宿夜者竟达一万多人。
建庵以来，文人雅士、达官贵人游踪不绝。宋大观四年（1110年），海临县令徐嘉言窟《登鹰窠顶望海中夏盖诸山》诗。明兵部给事中许相卿归隐后常在雪中戴斗笠、穿长蓑、乘黄犊登鹰窠顶，又在庵中接待邑令李当素，被传为佳话。清初，知县毛一骏撰《募修云岫疏》，带头发动重修云岫庵，著名学者黄宗义和吕留良也都在云岫庵留下足迹和诗文。
1992年5月，海盐县政府公布云岫庵保护范围和建设控制地带保护方案，同年8月，批准云岫庵为开放佛教活动场所，自此，云岫庵又上了一个新台阶。是年全国政协副主席、中国佛教协会会长赵朴初为云岫庵题额。次年，请山东省郓城县塑像世家葛化蛟、葛会君祖孙来庵塑四大金刚和观音菩萨三十二应身及三十二化身像，北京许宝癸、上海苏渊雷、嘉兴庄一拂、嘉善江蔚云、海宁蒋启霆、邑人富寿荪等文人学者都为云岫庵写诗题词、作画撰联，有《云岫庵八景》传世。在此前后，还由台湾廖世标、台胞冯子权、澉浦陈燕君等善男信女布施，添置铁鼎、铜蜡台、十八罗汉等佛像和法器。
如今，云岫庵在鹰窠顶山上，可谓是“万绿丛中一点红”。殿宇依山而筑，横向布局，中为殿堂区，右为游览区，左为生活服务区。在中轴线上，首为山门，上有“海上名山”是朝石刻，门阴为陈从周书“夜普陀”三个字，门内有明朝古银杏一株，清朝石狮子一对； 进二门，有铁鼎一座；过铁鼎，依次为金刚殿、观音殿和藏经阁，一殿高过一殿。在金刚殿和观音殿之间，有一口终年不竭、水质甘冽的“雪卖泉”，经化验为优质矿泉水。观音殿东配殿有“喷水鱼洗”，西配殿塑观音应身、化身像。“观音宝殿”由杭州高僧雪相法师题额，内塑毗户观音，法相庄严，旁有十八罗汉，观音殿后，有百年桂花一株，庭院广平，中置石案、石蜡台。最后就是藏经阁，建于五米高台基上，外观二层，实则一层，供奉木雕鰲鱼观音像，像高5.5米，为浙江最大木雕观音像，藏经阁围墙内山石嶙峋，中有一数百年榆树椿，如寿星屹立。
东院游览区院内花木扶疏，中间一口放生池，四周环以长古戏台、紫藤棚和石桌石凳，并有山茶、丁香、紫薇、芭蕉、梅树点缀春间，往后为一狭长地带，中有“洗心池”，池旁多天然裸露岩石。隔墙东望，可见“小成就石塔”耸立于绿树丛中，把庵内庵外景色融为一体，由于云岫庵香火旺盛，景色优美，故好事者归纳云岫庵有金、银、铜、铁、锡“镇山五宝”，均为谐音，即藏经（金）阁、银杏树、铜鱼洗、铁香炉、雪（锡）卖泉，可谓通俗又形象之比喻。
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