灵境寺在南台南麓的灵境村，距台怀镇25千米。创建于唐代，鼎新于宋代，明成化年间释清善重建，清嘉庆年间再修，昔日为五台山十大青庙之一。寺宇坐北面南，分为东窑院，山门院，中院和大殿院。
现存正殿3间，供释迦牟尼和迦叶、阿难。东西廊房各3间，均为清代建筑，西房内供地藏菩萨和日本送的灵仙三藏坐像。灵仙三藏为日本南都兴福寺法相宗僧、 日本国内供奉大德，他是日本与五台山佛教文化交流的创始人，也是惟一圆寂于五台山的日本僧人。1987年，日本东寺长者石山寺座主大僧正鹫尾隆辉于金阁寺 建了一座四柱六角碑亭，并立“日本国译经三藏灵仙和尚道德显彩之碑”，以示纪念。在本寺北面的山下，日本家本博先生等还托山西省文物商店工艺美术大师于 1995年设计建造了一座仿唐亭阁式青白玉塔，造型美观，十分好看。
灵境寺，位于五台山南台脚下，是五台山十大青庙之一，原名“金河寺”。魏文帝（公元471~499）时大兴土木建成 “金河寺”，当时寺院香火兴旺，高僧云集，《显密圆通成佛心要集》一经便出于该寺。此寺开山前，文殊菩萨曾以影开示众生，当地可建庙刹，有诗曰：“南台锦 锈智仙山，古木参天花语香，文殊影示告农家，直指十里传妙法。”
公元574年（北周建德三年），周武帝废教，寺庙改作宅第，驱僧还俗，经像焚烧，五台山佛教寺庙一毁而光，灵境寺也 未能幸免。公元593年隋文帝（开皇十三年）重建寺庙，设斋、度僧，五台山佛寺重新恢复发展。此时，古南台隐僧结草为庵，自行苦修，感化菩萨，坐禅有智， 得悟山脚有灵，下山寻之。在原名“金河寺”遗址，现在灵境寺，观辰（日義）东有光，细（日兆）似大佛，阿弥陀佛！天地造化之“仰天大佛”隐僧随即跪拜发 愿，集众筹募，扩建重修，寺庙竣工后，改名灵境寺。
公元630年（唐太宗）时，佛教文化进入高潮，取经译经，同时五台山佛教文化也进入一个新的发展阶段，灵境寺僧众渐多，有书坊、经坛。僧人开荒耕种循序有节，僧众发展到200多人，当时灵境寺很有名气，有很多高僧大德慕名而来。
公元820年（唐宪宗元和15年）日本奈良兴福寺高僧灵仙三藏，从南台入灵境寺，修道传法，受到灵境寺众僧欢迎，两年后灵仙三藏于本寺圆寂，为纪念日本高僧弘法功德，为其建塔一座名；三藏舍利塔，文革期间毁坏，现已修复。
明顺年间（公元1458年），灵境寺遭遇火劫，僧众散单，所留无几。
明成化年间（公元1465年），灵境寺重修，规模缩小，把仅存的一座伽蓝殿搁在寺外，到今为止。
清道光十二年（公元1833年），有续隆老和尚化缘重建灵境寺，建有正殿（华严三圣），东西偏殿、中殿（千手观音）、天王殿、山门，僧舍等（庙内碑记）。
明清时灵境寺成为五台山十大青庙之一。
灵境寺，岁月沧桑，兴衰变幻，在文革时有遭劫难。
现有佛弟子释悲胜主持，为寺院建设殚精竭力，四处奔波，多方筹款，重建庙宇、恢复道场、弘扬佛法，使得正法久住，普度众生离苦得乐。
如今的灵境寺在悲胜法师的精心管理下，又渐渐地恢复了往日的生机勃勃的景象，这其中悲胜法师可谓功不可没。
