本寺创于唐代，史名净慧禅寺，又名玉泉山，清晚期又称净慧讲寺，因地处旧属五十一都，（今大学），第七甲玉泉山，观者堪称其地尽得江山佳气，誉为九龙法界，亩有甲山、甲水、甲史、甲佛、甲殿、甲僧、甲钟更多甲马，故欲称七甲寺。
七甲寺原建规模宏大，分圣门、金刚殿、大雄宝殿、三圣殿四幢，边有僧房六十余间，占地7000平方米，属渐南罕见名山古刹，据寺内遗存碑铭记载，该寺曾经三废四兴，历尽沧桑，唐代宪宗元和庚子十五年（820年），由施照和尚募缘创建，唐广明庚子元年（880年）因兵乱而焚毁，不久闽僧石屋游此，观其圣迹非凡，于唐乾宁间继在此重建僧院，宋朝端拱乙丑二年（989年）复建大殿，大中祥符戌申元年（1008年），修整圣门。元末复遭遣乱而毁坏。明宣德年间复建，正德辛未六年（1511年）当山住持法林徒弟能全、能亮募缘修建，延到清代乾隆癸已三十八年（1773年），相传佛因法现身，见纷至募缘重建金刚殿，嘉庆八年，大学巡检司官孟裕视其殿宇破损，於癸亥年（1803年）再度修建，光绪丁未三十三年（1907年），先比丘谛闲法师因念寺观年久失修，再度主持修葺，但至十年内乱的1972年间，殿宇全遭拆毁，遗址辟之为田。
中国共产党十一届三中全会后，政通人和，普天咸呈瑞兆，1984年，天台正宗第四十六世住持僧释了识，倡持募缘复建三圣殿，1985年春，邑里众举周大森等为首事，释了识偕周日夜操劳，侨属胡克胜、华侨胡从库等解囊资助，十方百姓纷纷募资和投工献料，共攒资十余万元，同年十二月之朔告成大雄宝殿，大殿为木构重檐歇山造，高14.8米，面宽七开间，计24米，进深十三檩七柱，计15米，宝殿中，奉本师释迦牟尼佛，高9米多，两侧塑十八罗汉，正殿影壁，塑童子参观音为主尊的“八十四”堆山，计有一百一十七尊，鉴于匠者与有识之士博采历代寺观营建法式之精魂，复建大殿益显壮观宏伟。
1987年12月，县人民政府以文政字（87）第174号文件公布七甲寺为县级文物保护单位，规定原殿址重点保护区7000平方米等，受《中华人民共和国文物保护法》保护，玉泉山下的洗银坑，有宋代炼银遗址一处与摩崖题字等……
现今主持七甲寺上达下照法师，现任浙江普陀山佛学院讲师及研究生导师、浙江温州市妙果寺住持、浙江文成县佛教协会会长，法师从事天台、净土、禅宗（特别是“永嘉禅”）、密法的修学和研究，发表多篇专著。
