传统丛林道场重视制度，不但个人有戒牒，僧团也有清规。
“清规”是指禅宗寺院组织章程及寺众日常生活的规则，亦即禅宗丛林关于大众行、立、坐、卧等威仪所订定的僧制，为众僧所必须遵守的仪规，类似现代的“共住规约”，是为僧众日常修行的规范，以及僧团组织、行事的依循。因此，“清规”是健全僧团的圭臬。 中国禅宗自达摩东来后三百年中，禅僧多依住在律院或岩穴、树下，并未营立禅刹，直到唐朝“马祖创丛林，百丈立清规”，才开始营建禅刹，并参照大小乘经律，制定丛林规矩，撰清规二卷，广为流行，世称古规、古清规、百丈清规，这是禅宗清规的开始，此后，天下丛林皆依此而为寺院生活的仪则。 由于百丈禅师为禅宗丛林立下《百丈清规》，使得中国的僧团走向制度化、合理化的僧伽生活。例如明定四十八单职事，各司其职，使得寺务运作组织化、系统化；又订定各种修持行仪、日用轨范等，使得僧众具足威仪，心不放逸，身不踰矩。尤其设立住持一职，领众薰修，综理寺务，丛林规模于焉建立。 可惜《百丈清规》一书历经时代更迭，今已散佚。现行通用的《敕修百丈清规》，是元代江西百丈山住持德辉奉敕重新编修，其中前四章规定有关祝圣、国忌、祈祷、佛诞节、涅槃节、达摩忌、百丈忌及各寺历代诸祖忌等仪式，此皆律所未定，古规所缺者；五至九章，则为丛林的规章制度，包括住持日用、职事行事、两序进退、大众修持等。 《百丈清规》之后，我国陆续撰出的清规尚有：宋代宗赜作《禅苑清规》、瑞严无量宗寿禅师作《日用小清规》、婺州金华惟勉禅师作《丛林校定清规总要》、元代东林泽山弋咸禅师作《禅林备用清规》、中峰明本禅师作《幻住庵清规》、道齐作《禅苑清规总要》、继洪作《村寺清规》、明代天界道盛禅师作《寿昌清规》、清道光源洪禅师着《百丈清规证义》等，近代则有《金山江天禅寺规约》、《高旻寺规约》、《佛光山禅堂规约》等。 除了上述所列各种清规，道融的《丛林盛事》、惠彬的《丛林公论》、慧洪的《林间录》、净善的《禅林宝训》、无愠的《山庵杂录》等，都是认识丛林行事、仪规的重要文献。 此外，其他宗派也有仿效清规而制定规制者，如律宗的省悟作《律苑事规》三卷，天台宗的自庆作《教苑清规》一卷等。是以清规虽为百丈禅师首创，旨在建立禅宗规范，却为后世各宗各派所共遵。 丛林清规，礼法有度；丛林生活，祥和有序。丛林道场体现了中国儒家所向往的天下为公、人人崇乐好礼的理想蓝图，无怪乎时人每见僧团两序行仪，无不慨叹“礼失求诸野”！遗憾的是，明代以后，教门的规制混乱，丛林的行法也随之废弛。 现代丛林清规的主要内容有：一、结夏与结冬；二、安单；三、大请职；四、贴单；五、打七；六、普请；七、岁计；八、肃众；九、榜状牌示；十、钟鼓法器等。 “丛林之立，必有清规，所以警懈怠，防放逸也。”是以百丈禅师丛林要则二十条中说：“精进以持戒为第一。”清规一如戒律，戒律是佛陀为了规范僧伦，令正法久住而制定，所谓“戒住则僧住，僧住则法住”，六和僧团因为有佛制戒，始得和合共住，安心办道；因为有古德制定清规，而能清净无诤，弘法利生，为世人所尊。因此出家学道，宜遵佛制；能够遵守清规，方能度生死流，续佛慧命。
